中国海军已装备了斯特林发动机的039a/b /c常规AIP潜艇。国外资料显示，斯特林发动机技术成熟，结构简单，成本低，可靠性高。它被认为是一个完善的AIP系统。除中国之外，瑞典和日本首先将斯特林发动机作为潜艇的AIP系统，但该系统也有其自身的缺点。该系统仍有机械运动系统，这将增加潜艇的噪声辐射。此外，还需要采用浮筏阻尼系统来降低噪声。此外，该系统的功率过低，无法支持潜艇以较高的速度潜航。我国潜艇最新燃料电池AIP功率高于德国66%，潜航距离是以前十几倍。
在德国研制AIP潜艇时，燃料电池AIP系统是首选动力系统。与斯特林发动机相比，燃料电池具有能量转换效率高的优点。燃料电池通过电化学方法将化学能转化为电能，省去了机械发电必须经过的转换过程，降低了能量损耗，并能获得较高的能量转换率，效率可达70-80%左右。
另外，噪声小，是燃料电池AIP系统最大的优点。燃料电池的工作过程是能量的直接转换，不需要机械系统的参与，因此消除了潜艇的噪声源，而安静是潜艇最最关键的性能，因此燃料电池是一个非常有价值的系统，而且维护、制造和加工非常简便。由于系统没有机械运动部件，因此不存在磨损故障。而且，零件加工要求低，易于制造和加工。通过集中控制的方式，还可以实现各辅助系统的控制，顺利实现自动化。
燃料电池也有一系列的缺点，其中一个主要的缺点是它需要大量的氢，而氢的储存和运输非常复杂且危险。产生化学能需要贵金属作为催化剂，价格和成本都很高，这也是其实际应用的一个大障碍。但是同它的诸多优点相比，有钱国家的钱不是问题。由于燃料电池的低噪声特性，许多国家都将其应用于潜艇AIP系统中。除德国之外，俄罗斯、西班牙和意大利也计划使用燃料电池AIP系统。据说日本全新一代潜艇还计划用燃料电池AIP系统取代现有潜艇的斯特林发动机。德国214潜艇燃料电池AIP系统的电池功率为300KW。已经可以保障潜艇在水下以4-6节速度航行21天以上，相当于普通铅酸电池潜艇的10倍。
近日，在上海举行的第二十届中国国际海事大会暨展览会之上，中国船舶712研究院（下列简称712研究院）发布了首个具有自主知识产权的500kw船舶燃料电池系统解决方案。据悉，712研究所研制的船用氢燃料电池系统具有能量转换效率高、振动噪声小、零排放、无污染等优点，是未来发展高技术船舶的理想动力能源设备。
712研究院作为中国船舶重工集团氢能及燃料电池系统领域的核心研究单位，长期专注于燃料电池在船舶、全新能源汽车、分布式发电等领域的应用，坚持自主开发，积累了综合技术高安全性储氢和燃料电池的基础之上，开发了多种燃料电池产品，并在行业潜力方面处于领先地位。我国的大功率燃料电池AIP系统已可以顺利装备到潜艇上了，再配以大容量锂电池，潜航的距离和速度将远远超越现有潜艇。
